आंतरिक लेखा परीक्षा संगठन की स्थापना 1 जुलाई १९७७ को दिल्ली के संघ राज्य क्षेत्र में हुई| इसने मुख्य लेखा संगठन की शाखाओं में से एक के रूप में 31 मई १९८१ तक काम करना जारी रखा|1 जून १९८१ से यह लेखा परीक्षा की निदेशालय की एक स्वतंत्र इकाई है|लेखा परीक्षा निदेशालय के नेतृत्व में अपर सचिव वित्त और उप लेखा नियंत्रक (लेखा परीक्षा) ने प्रधान सचिव (वित्त) की सहायता की है|
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